Mycobacterium tuberculosis штаммдарын

Қазақстан аумағында таралған дәріге төзімді Mycobacterium tuberculosis штаммдарын протеогеномдық талдау

Зерттеу барысында ДНҚ және бөліп алу, ПТР, нақты уақыт тәртіптемесіндегі ПТР, секвенирлеу секілді молекулалы-генетикалық әдістер қолданылды.

Зерттеу нәтижесінде геномдық кітапханалар әзірленді, сондай-ақ дәрілік сезімталдықтың әртүрлі спектрі бар M. tuberculosis іріктелген изоляттарына толық геномды жүйелеу жүргізілді. Іріктелген M. tuberculosis изоляттарының бірінші және екінші қатарлы дәрілерге төзімді қарсылық профилі анықталды. Бірінші қатарлы туберкулезге қарсы препараттарға төзімді клиникалық маңызды M. tuberculosis мутацияларының спектрі, katG, rpoB, embB, pncA, rpsL гендерімен және fabG1 генінің промоторлы аймағымен ұсынылған. Екінші сатылы туберкулезге қарсы препараттарға төзімді M. tuberculosis мутациялық спектрі gyrA, eis және rrs гендерімен ұсынылды. Алынған нәтижелердің жаңалығы. Толық геномдық жартылай өткізгішті секвенционды технологияны қолдануға негізделген M. tuberculosis штаммдарының молекулярлық терудің заманауи тәсілін қолдану.

Микобактерия изоляттарының дәріге төзімдігін анықтау нәтижесінде қымбат дәрілерді қате тағайындау мүмкіндігі болмайды

фтизиатрия

Mycobacterium tuberculosis штаммдарын

Қазақстан аумағында таралған дәріге төзімді Mycobacterium tuberculosis штаммдарын протеогеномдық талдау

Зерттеу барысында ДНҚ және бөліп алу, ПТР, масс-спектрометрия, секвенирлеу секілді молекулалы-генетикалық әдістер қолданылды.

Зерттеулер нәтижесінде бірінші және екінші қатардағы препараттарға төзімділікті анықтайтын қарсылық бейінін анықтау үшін M. tuberculosis микобактериясының он жинау үлгісіне геномдық талдау жүргізілді. Геномды-саналы жүйеге сүйене отырып, M. tuberculosis гендеріндегі мутацияға талдау жасалды, ол бірінші және екінші қатардағы дәрілерге төзімділікті анықтады, он изоляттың кедергі профилі анықталды. M. tuberculosis үлгілері үшін сполиготиптеу хаттамасы жасалды және оңтайландырылды. Алынған нәтижелердің жаңалығы. Толық геномдық жартылай өткізгішті секвенционды технологияны қолдануға негізделген M. tuberculosis штаммдарының молекулярлық терудің заманауи тәсілін қолдану.

Микобактерия изоляттарының дәріге төзімдігін анықтау нәтижесінде қымбат дәрілерді қате тағайындау мүмкіндігі болмайды

фтизиатрия

Зерттеу нысаны дәрілік сезімталдықтың әртүрлі спектрі бар M. tuberculosis клиникалық изоляттары, сондай-ақ h37rv мұражай штаммы болып табылады.

Цель работы – проведение комплексного молекулярно-генетического анализа лекарственно-устойчивых штаммов Mycobacterium tuberculosis, циркулирующих на территории Республики Казахстан.

Зерттеу әдістері. Процесс барысында ДНҚ оқшаулау, ПТР, масс-спектрометрия, толық геномдық реттілік сияқты молекулалық-генетикалық әдістер қолданылды.

Алынған нәтижелер. Зерттеулер нәтижесінде бірінші және екінші қатардағы препараттарға төзімділікті анықтайтын төзімділік профилін анықтау үшін M. tuberculosis 13 коллекциялық үлгілеріне толық геномдық талдау жүргізілді. Толық геномдық секвенирлеу негізінде M. tuberculosis гендеріндегі мутацияларға талдау жүргізілді, ол бірінші және екінші қатардағы препараттарға төзімділікті негіздейді, 13 изоляттың резистенттілік бейіні анықталды. M. tuberculosis үлгілерін сполиготиптеу хаттамасы жасалды. Әзірленген сполиготиптеу әдісінің көмегімен зондты ұзарту реакциясы негізінде кейіннен масс-спектрометриялық талдау арқылы Қазақстан аумағында айналатын M. tuberculosis 103 үлгісін сполиготиптеу жүргізілді. Алынған нәтижелердің жаңалығы толық геномдық секвенирлеу технологиясын пайдалануға негізделген M. tuberculosis штаммдарын молекулярлық типтеудің қазіргі заманғы тәсілін қолдану, сондай-ақ классикалық будандастыру әдісін алмастыра алатын масс-спектрометриялық талдау негізінде сполиготиптеу әдісін әзірлеу болып табылады.

Жоба іргелі болғандықтан, нәтижелерді енгізу дәрежесі мен негізгі техникалық-экономикалық көрсеткіштер жоғары емес.

Экономикалық тиімділік – микобактерия изоляттарының дәрілік тұрақтылық түрін дәл анықтау нәтижесінде қымбат тұратын дәрілік заттарды дұрыс тағайындамау мүмкіндігі жоққа шығарылады.

Қолдану саласы - фтизиатрия

Зерттеу нысаны дәрілік сезімталдықтың әртүрлі спектрі бар M. tuberculosis клиникалық изоляттары, сондай-ақ h37rv мұражай штаммы болып табылады.

Цель работы – проведение комплексного молекулярно-генетического анализа лекарственно-устойчивых штаммов Mycobacterium tuberculosis, циркулирующих на территории Республики Казахстан.

Зерттеу әдістері. Процесс барысында ДНҚ оқшаулау, ПТР, масс-спектрометрия, толық геномдық реттілік сияқты молекулалық-генетикалық әдістер қолданылды.

Алынған нәтижелер. Зерттеулер нәтижесінде бірінші және екінші қатардағы препараттарға төзімділікті анықтайтын төзімділік профилін анықтау үшін M. tuberculosis 13 коллекциялық үлгілеріне толық геномдық талдау жүргізілді. Толық геномдық секвенирлеу негізінде M. tuberculosis гендеріндегі мутацияларға талдау жүргізілді, ол бірінші және екінші қатардағы препараттарға төзімділікті негіздейді, 13 изоляттың резистенттілік бейіні анықталды. M. tuberculosis үлгілерін сполиготиптеу хаттамасы жасалды. Әзірленген сполиготиптеу әдісінің көмегімен зондты ұзарту реакциясы негізінде кейіннен масс-спектрометриялық талдау арқылы Қазақстан аумағында айналатын M. tuberculosis 103 үлгісін сполиготиптеу жүргізілді. Алынған нәтижелердің жаңалығы толық геномдық секвенирлеу технологиясын пайдалануға негізделген M. tuberculosis штаммдарын молекулярлық типтеудің қазіргі заманғы тәсілін қолдану, сондай-ақ классикалық будандастыру әдісін алмастыра алатын масс-спектрометриялық талдау негізінде сполиготиптеу әдісін әзірлеу болып табылады.

Жоба іргелі болғандықтан, нәтижелерді енгізу дәрежесі мен негізгі техникалық-экономикалық көрсеткіштер жоғары емес.

Экономикалық тиімділік – микобактерия изоляттарының дәрілік тұрақтылық түрін дәл анықтау нәтижесінде қымбат тұратын дәрілік заттарды дұрыс тағайындамау мүмкіндігі жоққа шығарылады.

Қолдану саласы - фтизиатрия