Штаммы Mycobacterium tuberculosis

Протеогеномный анализ лекарственно-устойчивых штаммов Mycobacterium tuberculosis, циркулирующих в Казахстане

В процессе работы использовались такие молекулярно-генетические методы, как выделение ДНК, ПЦР, ПЦР в режиме реального времени, секвенирование.

В результате исследований была проведена подготовка геномных библиотек, а также проведено полногеномное секвенирование отобранных изолятов M. tuberculosis с различным спектром лекарственной чувствительности на основе подготовленных геномных библиотек. Определен профиль резистентности отобранных изолятов M. tuberculosis, обуславливающий устойчивость к препаратам первого и второго ряда. Спектр клинически значимых мутаций M. tuberculosis, ассоциированных с устойчивостью к противотуберкулезным препаратам первого ряда был представлен генами katG, rроВ, embB, pncA, rpsL и промоторной области гена fabG1. Спектр мутаций M. tuberculosis, ассоциированных с устойчивостью к противотуберкулезным препаратам второго ряда, был представлен генами gyrA, eis и rrs. Новизна полученных результатов заключается в применении современного подхода молекулярного типирования штаммов M. tuberculosis, основанного на использовании технологии полногеномного полупроводникового секвенирования.

В результате определения вида лекарственной устойчивости изолятов микобактерии исключается возможность неправильного назначения дорогостоящих лекарственных средств.

фтизиатрия

Штаммы Mycobacterium tuberculosis

Протеогеномный анализ лекарственно-устойчивых штаммов Mycobacterium tuberculosis, циркулирующих в Казахстане

В процессе работы использовались такие молекулярно-генетические методы, как выделение ДНК, ПЦР, масс-спектрометрия, секвенирование.

В результате исследований был проведен полногеномный анализ десяти коллекционных образцов M. tuberculosis для определения профиля резистентности, обуславливающего устойчивость к препаратам первого и второго ряда. На основе полногеномного секвенирования был проведен анализ мутаций в генах M. tuberculosis, обуславливающий устойчивость к препаратам первого и второго ряда, определен профиль резистентности десяти изолятов. Был разработан и оптимизирован протокол сполиготипирования образцов M. tuberculosis. Новизна полученных результатов заключается в применении современного подхода молекулярного типирования штаммов M. tuberculosis, основанного на использовании технологии полногеномного полупроводникового секвенирования.

В результате определения вида лекарственной устойчивости изолятов микобактерии исключается возможность неправильного назначения дорогостоящих лекарственных средств.

фтизиатрия

Объектом исследования являются клинические изоляты M. tuberculosis с различным спектром лекарственной чувствительности, а также музейный штамм H37Rv.

Цель работы – проведение комплексного молекулярно-генетического анализа лекарственно-устойчивых штаммов Mycobacterium tuberculosis, циркулирующих на территории Республики Казахстан.

В процессе работы использовались такие молекулярно-генетические методы, как выделение ДНК, ПЦР, масс-спектрометрия, полногеномное секвенирование.

В результате исследований был проведен полногеномный анализ 13 коллекционных образцов M. tuberculosis для определения профиля резистентности, обуславливающего устойчивость к препаратам первого и второго ряда. На основе полногеномного секвенирования был проведен анализ мутаций в генах M. tuberculosis, обуславливающий устойчивость к препаратам первого и второго ряда, определен профиль резистентности 13 изолятов. Был разработан протокол сполиготипирования образцов M. tuberculosis. С помощью разработанного метода сполиготипирования на основе реакции удлинения зонда с последующим масс-спектрометрическим анализом проведено сполиготипирование 103 образцов M. tuberculosis, циркулирующих на территории Казахстана. Новизна полученных результатов заключается в применении современного подхода молекулярного типирования штаммов M. tuberculosis, основанного на использовании технологии полногеномного секвенирования, а также разработке метода сполиготипирования на основе масс-спектрометрического анализа, способного заменить классический гибридизационный метод.

Так как проект фундаментальный, степень внедрения результатов и основные технико-экономические показатели остаются невысокими.

Экономическая эффективность – в результате точного определения вида лекарственной устойчивости изолятов микобактерии исключается возможность неправильного назначения дорогостоящих лекарственных средств.

Область применения – фтизиатрия

Объектом исследования являются клинические изоляты M. tuberculosis с различным спектром лекарственной чувствительности, а также музейный штамм H37Rv.

Цель работы – проведение комплексного молекулярно-генетического анализа лекарственно-устойчивых штаммов Mycobacterium tuberculosis, циркулирующих на территории Республики Казахстан.

В процессе работы использовались такие молекулярно-генетические методы, как выделение ДНК, ПЦР, масс-спектрометрия, полногеномное секвенирование.

В результате исследований был проведен полногеномный анализ 13 коллекционных образцов M. tuberculosis для определения профиля резистентности, обуславливающего устойчивость к препаратам первого и второго ряда. На основе полногеномного секвенирования был проведен анализ мутаций в генах M. tuberculosis, обуславливающий устойчивость к препаратам первого и второго ряда, определен профиль резистентности 13 изолятов. Был разработан протокол сполиготипирования образцов M. tuberculosis. С помощью разработанного метода сполиготипирования на основе реакции удлинения зонда с последующим масс-спектрометрическим анализом проведено сполиготипирование 103 образцов M. tuberculosis, циркулирующих на территории Казахстана. Новизна полученных результатов заключается в применении современного подхода молекулярного типирования штаммов M. tuberculosis, основанного на использовании технологии полногеномного секвенирования, а также разработке метода сполиготипирования на основе масс-спектрометрического анализа, способного заменить классический гибридизационный метод.

Так как проект фундаментальный, степень внедрения результатов и основные технико-экономические показатели остаются невысокими.

Экономическая эффективность – в результате точного определения вида лекарственной устойчивости изолятов микобактерии исключается возможность неправильного назначения дорогостоящих лекарственных средств.

Область применения – фтизиатрия