Клещи, собранные в областях Южного региона Казахстана, выделенные из клещей препараты нуклеиновых кислот, и сыворотки больных с лихорадками неясного генеза и лиц, укушенных клещами, в Южном регионе Казахстана.

Изучение распространения разных видов риккетсий у клещей в Южном регионе Казахстана, проведение генотипирования выделенных ДНК риккетсий, выявление циркуляции патогенных риккетсий у людей, а также совершенствование лабораторно-этиологической диагностики риккетсиозов и разработка стратегии эпидемиологического надзора за риккетсиозами в Республике Казахстан

Сбор клещей методом «флага», морфологическая идентификация и дифференциация клещей согласно таксономическим ключам, измельчение отсортированных в пулы клещей по СОП № CRL-NCB-SA-SOP-007, экстракция нуклеиновых кислот, ПЦР, электрофорез, забор венозной крови и подготовка крови к серологическому исследованию согласно СОП № NCB-SA-SOP-003, ИФА на определение сывороточных антител к риккетсиям

Разработан ряд внутренних стандартных операционных процедур (СОП), необходимых для его реализации проекта. Проведен сбор 700 клещей в Южном регионе Казахстана и их морфологическая идентификация до вида. Всего идентифицировано 8 видов клещей: Ix .persulcatus, Ix.ricinus H. punctata, D. pictus, D. niveus, D. marginatus, R. tiranicus, H. asiaticum. Образцы пулированы по 10 экземпляров. Создана и постоянно пополняется база данных с одновременной регистрацией геоданных для дальнейшего уточнения видового разнообразия в местах распространения. Проведена экстракция нуклеиновых кислот из полученных гомогенизатов клещей. Проведен ПЦР-анализ 25 пулов, сформированных из клещей семейства Ixodidae, собранных в Жамбылской и Алматинской областях. Показано наличие ДНК Rickettsia spp в 2 пулах, сформированных из клещей Dermacentor niveus и Ixodes persulcatus. Подобраны праймеры для дальнейшей идентификации риккетсий и их видового разнообразия в клещевых гомогенизатах.

Собрано 46 образцов сыворотки крови от 23 больных с лихорадками неясного генеза и 288 сывороток у лиц, укушенных клещами в Алматинской области. Проанализированы сыворотки больных с лихорадками неясного генеза и по результатам анализа выявлено наличие острого риккетсиозного заболевания у 1 больного. Из собранных 288 сывороток, полученных от лиц, обратившихся с укусами клещей, было проанализировано 93 образца сыворотки. В 8 сыворотках обнаружены антитела к риккетсиям группы пятнистых лихорадок

Эпидемиология, инфекционные болезни

Клещи, препараты нуклеиновых кислот, сыворотки больных и здоровых людей.

Изучение распространения разных видов риккетсий у клещей в Южном регионе Казахстана, проведение генотипирования выделенных ДНК риккетсий, выявление циркуляции патогенных риккетсий у людей, а также совершенствование лабораторно-этиологической диагностики риккетсиозов и разработка стратегии эпидемиологического надзора за риккетсиозами в Республике Казахстан.

Сбор клещей методом «флага», морфологическая идентификация, выделение нуклеиновых кислот, ПЦР, электрофорез, ИФА.

ПЦР в реальном времени исследованы 268 одиночных клещей из 539 собранных. Общий уровень инфицированности клещей риккетсиями группы пятнистых лихорадок составил 72,4%. Выявлена циркуляция патогенных видов риккетсий R. raoultii и R. aeschlimannii. Собраны 1314 сывороток у здоровых и 154 у лихорадящих людей. Анализ 93 образцов от здоровых и 72 от больных людей на антитела к риккетсиям группы клещевых пятнистых лихорадок выявил наличие антител IgG (22,6 %) и IgМ (4,1%). Серологические исследования 253 сывороток на наличие IgG к Rickettsia typhi выявило 34,4% позитивных образцов. Разработаны СОПы молекулярной и серологической диагностики R. typhi, определения случая эндемического тифа и клещевого риккетсиоза. Разработан алгоритм диагностики риккетсиозов. Проведен эпидемиологический анализ для выявления заражения R. typhi и риккетсиями группы пятнистых лихорадок.

ПЦР в реальном времени исследованы 268 одиночных клещей из 539 собранных. Общий уровень инфицированности клещей риккетсиями группы пятнистых лихорадок составил 72,4%.Собраны 1314 сывороток у здоровых и 154 у лихорадящих людей. Серологические исследования 253 сывороток на наличие IgG к Rickettsia typhi выявило 34,4% позитивных образцов. Разработаны СОПы молекулярной и серологической диагностики R. typhi, определения случая эндемического тифа и клещевого риккетсиоза.

Эпидемиология, инфекционные болезни.

клещи, сыворотки больных с лихорадками неясного генеза и здоровых жителей южного региона Казахстана

изучение распространения разных видов риккетсий у клещей в южном регионе Казахстана, проведение генотипирования выделенных ДНК риккетсий, выявление циркуляции патогенных риккетсий у людей, а также совершенствование лабораторно-этиологической диагностики риккетсиозов и разработка стратегии эпидемиологического надзора за риккетсиозами в Республике Казахстан.

сбор клещей методом «флага» и с укушенных людей, морфологическая идентификация клещей, гомогенизация клещей, экстракция нуклеиновых кислот, ПЦР анализ, электрофорез нуклеиновых кислот, элюция ДНК из геля, секвенирование ДНК, спектрофотометрия, ИФА, методы описательной и аналитической эпидемиологии.

Проведен сбор клещей эпидсезонов 2018-2020 гг. в южном регионе Казахстана. Всего собрано 1 117 клещей, создана база геоданных точек сбора. Проведен ПЦР-анализ препаратов ДНК из 428 индвидуальных клещей, который показал, что уровень инфицированности клещей риккетсиями группы пятнистых лихорадок равен 69,9%. ДНК Rickettsia sibirica обнаружена в 7,2% образцов. Проведена генетическая характеристика выявленных в клещах риккетсий. По локусу 190-70 и 190-602 гена OmpA проведено секвенирование риккетсий из 24 клещей. По локусу 816-843 и 1135-1156 гена GltA проведено секвенирование ДНК риккетсий, идентифицированных в 13 клещах. По локусу 3588-3607 и 4406-4387 гена OmpA проведено секвенирование ДНК риккетсий из 7 клещей. В Алматинской области впервые показана циркуляция патогенного для человека вида Candidatus R. tarasevichiae, подтверждена циркуляция патогенных для человека видов R. raoultii и R. aeschlimannii. Проведен сбор образцов сыворотки у 2927 жителей и 188 лихорадящих пациентов в южном регионе Казахстана. Показано, что серопревалентность IgG к R. typhi равна 34,4%. IgG к риккетсиям пятнистых лихорадок обнаружены в 22,6% образцов. Выявлены эндемичные по риккетсиозам области. Разработано стандартное определение случая эндемического тифа и клещевого риккетсиоза.

не предусмотрены

эпидемиология, инфекционные болезни.