ОБЩИЕ СВЕДЕНИЯ
ИРНAP05134291, Номер госрегистрации0118РК00112
Наименование«Секвенирование генома Scorzonera tau-saghyz ((Lipsch. & G.G.Bosse) и ассоциативное картирование генома по признаку содержания каучука»
Приоритетное направлениеНаука о жизни и здоровье
Вид исследованияФундаментальное
ЗаявительДочернее государственное предприятие на праве хозяйственного ведения "Научно-исследовательский институт проблем биологии и биотехнологии" РГП на праве хозяйственного ведения "Казахский национальный университет им. Аль-Фараби"
Научный руководительБогуспаев Карим Касымович
Балл ГНТЭ28.33
Общая одобренная сумма24000000
Решение ННС
Ожидаемые результаты
Будут проведены экспедиционные работы с целью сбора образцов (семена, листья, корни) из естественных популяций Scorzonera tau-saghyz в горах Каратау. Будут проведены цитогенетические исследования собранного растительного материала. Будет проведено кариосистемное исследование и оценка содержания ядерной ДНК;
Будут проведены морфологический и биохимический анализы образцов тау-сагыза
Будет проведено генотипирование посредством секвенирования (GBS) образцов из естественных популяций тау-сагыза для генерации маркеров однонуклеотидного полиморфизма.
Будет проведен отбор высокопродуктивных образцов тау-сагыза на основе полученных результатов, для селекционных работ по получению новых сортов
Реферат (Абстракт) - 2018 год
Объект исследования, разработки или проектирования
Семена и вегетативные органы (корень, листья, стебель, соцветия) Тау-сагыза.
Цель работы
2018г. Сбор и фиксация образцов тау-сагыза (семена, листья, корни, латекс) из различных экотипов. Исследование морфологических и биохимических признаков, связанных с накоплением каучука.
Методы исследования
Ботаническое описание, определение хлорофилла и каротиноидов, определение содержания каучука, ЯМР анализ, хромосомный анализ, количественное определение ДНК (флау-спектрометрия)
Полученные результаты и новизна
В процессе выполнения экспедиционных работ обнаружены новые места обитания Тау-сагыза. Отобраны образцы семян и вегетативных органов в необходимом количестве.
В результате исследований было установлено, что количество листьев и каудексов коррелирует с накоплением каучука в корнях. Связь между листьями и корнем устанавливается через каудексы, считая, что система проводящих пучков следует от листьев через каудекс в корень. ЯМР-анализ показал высокое качество каучука в образцах.
Установленные морфологические и биохимические признаки будут использованы в работе по картированию генома Тау-сагыза.
Основные конструктивные и технико экономические показатели
Ассоциативное картирование известное также как картирование неравновесного сцепления (linkage disequilibrium- LD) или анализ ассоциаций является новейшим методом картирования, основанным на изучении популяций, является базой для ускоренного создания новых высокопродуктивных сортов Тау-сагыза.
Степень внедрения
Лабораторные исследования
Эффективность
Секвенирование и ассоциативное картирование генома по признаку содержания каучука позволит выявить перспективные линии для использования в селекционных программах для получения новых продуктивных сортов Тау-сагыза.
Область применения
Резиновая промышленность
Реферат (Абстракт) - 2019 год
Объект исследования, разработки или проектирования
Семена, вегетативные органы (лист, соцветия, корень) Тау-сагыза (Scorzonera tau-saghyz Lipsch. & Bosse).
Цель работы
Сбор и фиксация образцов тау-сагыза (семена, листья, корни, латекс) из различных экотипов. Исследование корреляции по морфологическим и биохимическим признакам популяций тау-сагыза, связанных с накоплением каучука. Выделение, и анализ образцов ДНК из естественных популяций.
Методы исследования
Сбор семян Тау-сагыза
Сбор и фиксация образцов вегетативных органов
Цитоэмбриологический (хромосомный) анализ
Кариосистемное исследование, оценка содержания ядерной ДНК и определение размера генома Тау-сагыза.
Определение содержания пигментов
Определение содержания каучука.
Статистический анализ на основе T-критерия
Выделение ДНК из листьев Тау-сагыза
Функциональный анализ ДНК
Полученные результаты и новизна
В процессе выполнения экспедиционных работ отобраны образцы семян и вегетативных органов в необходимом количестве.Впервые установлено, что содержание пигментов (хлорофилл (a+b) каратиноиды) в листьях тау-сагыза не коррелируют с накопления каучука в корнях.
Впервые построено филогенетическое дерево Scorzonera Tau-saghyz и определен размер генома, который равен приблизительно 4,8 Гб (гигабайт
Основные конструктивные и технико экономические показатели
Получено 2 патента РК. 1. Технология микроклонального размножения Тау-сагыза.2.Способ выделения каучука из сухих корней тау-сагыза.
Степень внедрения
Готовые к использованию
Эффективность
Высокая
Область применения
Резиновая промышленность, медицина, машиностроение
Реферат (Абстракт) - 2020 год
Объект исследования, разработки или проектирования
Семена и вегетативные органы (корень, листья, стебель, соцветия) Тау-сагыза.
Цель работы
Генотипирование посредством секвенирования (GBS) образцов, генерация маркеров однонуклеотидного полиморфизма и отбор высопродуктивных линий.
Методы исследования
Сбор и фиксация образцов вегетативных органов. Цитоэмбриологический (хромосомный) анализ. Определение содержания пигментов. Определение содержания каучука. Статистический анализ на основе T-критерия. Статистический анализ на основе корреляции Пирсона. Корреляционный анализ Пирсона рассчитывается по стандартной формуле. Выделение ДНК из листьев Тау-сагыза. Функциональный анализ ДНК. Определение размера генома Тау-сагыза. Генотипирование посредством секвенирования (GBS).
Полученные результаты и новизна
в процессе выполнения экспедиционных работ отобраны образцы семян и вегетативных органов в необходимом количестве. Впервые установлено, что содержание пигментов (хлорофилл (a+b) каратиноиды) в листьях тау-сагыза не коррелируют с накопления каучука в корнях.
На основе данных GBS впервые построено филогенетическое дерево Scorzonera Tau-saghyz и определен размер генома, который равен приблизительно 4,8 Гб (гигабайт). На основе полученных результатов отобраны перспективные линии Тау-сагыза для дальнейших селекционных работ.
Основные конструктивные и технико экономические показатели
На основе данных GBS впервые построено филогенетическое дерево Scorzonera Tau-saghyz и определен размер генома
Эффективность
Эффективность высокая.
Область применения
Резиновая промышленность, медицина, машиностроение.
Реферат (Абстракт) - 2020 год
Объект исследования, разработки или проектирования
Семена и вегетативные органы (корень, листья, стебель, соцветия) Тау-сагыза.
Цель работы
Генотипирование посредством секвенирования (GBS) образцов, генерация маркеров однонуклеотидного полиморфизма и отбор высопродуктивных линий.
Методы исследования
Сбор и фиксация образцов вегетативных органов. Цитоэмбриологический (хромосомный) анализ. Определение содержания пигментов. Определение содержания каучука. Статистический анализ на основе T-критерия. Статистический анализ на основе корреляции Пирсона. Корреляционный анализ Пирсона рассчитывается по стандартной формуле. Выделение ДНК из листьев Тау-сагыза. Функциональный анализ ДНК. Определение размера генома Тау-сагыза. Генотипирование посредством секвенирования (GBS).
Полученные результаты и новизна
в процессе выполнения экспедиционных работ отобраны образцы семян и вегетативных органов в необходимом количестве. Впервые установлено, что содержание пигментов (хлорофилл (a+b) каратиноиды) в листьях тау-сагыза не коррелируют с накопления каучука в корнях. На основе данных GBS впервые построено филогенетическое дерево Scorzonera Tau-saghyz и определен размер генома, который равен приблизительно 4,8 Гб (гигабайт). На основе полученных результатов отобраны перспективные линии Тау-сагыза для дальнейших селекционных работ.
Основные конструктивные и технико экономические показатели
На основе данных GBS впервые построено филогенетическое дерево Scorzonera Tau-saghyz и определен размер генома
Эффективность
Эффективность высокая
Область применения
Резиновая промышленность, медицина, машиностроение.